OSIM (Organisasi Siswa Intra Madrasah) dan MPK (Majelis Perwakilan Kelas) merupakan organisasi peserta didik di MAN 1 Kota Cirebon yang menjadi wadah pengembangan kepemimpinan, karakter, serta kemampuan berorganisasi. Melalui berbagai program kerja dan kegiatan kesiswaan, anggota OSIM dan MPK dilatih untuk memiliki jiwa kepemimpinan, tanggung jawab, komunikasi yang baik, serta mampu bekerja sama dalam melayani dan menginspirasi warga madrasah. Organisasi ini juga berperan aktif dalam merancang, mengawal, dan mengevaluasi berbagai kegiatan sekolah sehingga tercipta budaya madrasah yang aktif, demokratis, dan berprestasi.